杞县孔庙坐落于杞县金城大道中段，孔庙俗称黉学院，即古代讲学的地方，相传每年农历二八月上丁日，要在这里举行祭祀孔子大典活动。每年乡试结束，考中的才子们便在这里祭祀孔子。它既是为纪念中国古代著名思想家、教育家孔子而修建的庙宇，也是在开封历史上有着鼎鼎大名的杞县大同中学旧址。

孔庙的主体建筑是大成殿。大成殿始建于明洪武三年（1370年），东西长23．6米，南北宽18．5米，高15米，属木结构歇山式建筑。远远望去，大成殿彩色琉璃瓦盖顶，殿顶宽阔，坡度坦缓，四角屋檐凌空飞挑，琉璃神兽雕像稳居檐脊，神兽造型形神兼备，栩栩如生。大殿屋顶有26根粗壮的圆木柱子支撑，圆柱底座为鼓形束腰的石墩，这种木质叠架的建筑厚重结实，使大殿历经几百年的风雨却依然坚固。从整体建筑风格上看，这座建于明代的建筑，却明显保留了元代建筑艺术的大气恢宏和古朴端庄，在建筑领域非常罕见，也极其珍贵。

1920年初，进步知识分子孟昭朴、孟昭渠在杞县孔庙开办了一所私塾，专门招收追求进步的13至18岁的中小学生和其他私塾学生。1924年夏，原私塾学生、在南京读书的马沛毅经郓代英介绍加入青年团，不久转为中共党员，回杞县开展建团工作，1925年5月下旬成立共青团杞县特别支部，8月成立了中共杞县特别支部，后又建立了杞县地委和杞县县委。

数百年来，这里成了杞县人民尊师重教的场所。1932年秋，杞县著名爱国民主人士、留德博士王毅斋在中共杞县地下党组织的支持下创办大同小学，1934年夏，党组织又派王国权(原名康午生)协助王毅斋在杞县小西门里路北天帝庙内创办了杞县私立大同中学，次年暑假迁至孔庙后院明伦堂。现代著名作家姚雪垠曾两次在这里讲学。1936年，学校部分师生参加了“中华民族解放先锋队”、“抗日校园大同盟”、“读书研究会”等进步组织，并在党领导下创办《辟鸥》杂志，积极进行抗日救亡活动。1937年，中共杞县委员会秘密设在该校内。1938年杞县沦陷后，学校停办，部分师生参加了豫东游击三支队（后编入新四军第四师），另一部分西上延安奔赴抗日前线，杞县大同中学为国家培养了大批革命志士。

新中国成立后曾加修葺，1959年公布为县级文物保护单位。1966年“文革”中，大成殿顶盖、檐饰、浮雕被毁。孔庙现存大成殿5楹与东西庑房四合院及古柏、古槐。县文化局曾设在此处，大成殿辟为县文化馆展览室，文物、书画等在此展出。1986年，被省政府公布为省级重点文物保护单位。如今，杞县孔庙已成为人们休闲娱乐的重要场所。